一种图形化的多构型变换航天器控制系统仿真程序生成方法，包括组合体动力学模型构建方法；快速模型封装及模型库构建方法；多构型变换航天器控制系统建模方法；模型自动连线与布局方法；仿真程序自动生成方法。本发明能够对C/C++语言编写的基本模型(包括敏感器模型、控制器模型、执行机构模型、动力学模型、环境模型等)，进行规范化和集中管理，形成可复用模型库，采用数字化手段，以图形化交互操作方式，能够快速搭建出多构型变换的航天器控制系统仿真模型，自动生成支持多构型变换的控制系统仿真程序，所述方法已在空间站研制过程中应用，解决了空间站多构型仿真难于维护的难题，显著提升研制效率。