基于数字孪生的航天器生产车间运行仿真评估方法及系统，包括：收集车间运行状态事件的历史数据，基于所述历史数据确定事件发生所服从概率分布模型；根据事件的所述概率分布模型生成将来事件表；根据将来事件表基于概率分布模型生成车间运行的驱动事件，再根据所述驱动事件的处理逻辑做出相应的处理动作得到处理结果；所述驱动事件包括到达事件、加工结束事件、离开事件；对所述处理结果进行统计，更新系统状态，再产生新的事件，基于新事件更新将来事件表。计算单个周期内事件的平均响应时间，若单个周期内的平均响应时间大于总体平均响应时间，则该单个周期为生产任务高峰期。本发明能够实现车间运行状态仿真预测，提升航天器制造能力。