本发明公开了一种生成端到端实体链接方法和系统，包括：基于待链接实体的类型、属性、关系、名称，构建待链接实体序列；待链接实体为第一知识图谱中的实体；将待链接实体序列作为输入序列输入到训练好的seq2seq模型中进行指称识别和实体消歧，得到多个推荐实体名称；多个推荐实体名称为第二知识图谱中的实体名称；基于n‑gram相似度和分词召回率计算每个推荐实体名称的评分；基于每个推荐实体名称的评分，确定待链接实体在第二知识图谱中所对应的目标链接实体。本发明缓解了现有模型中两阶段任务带来的误差损失。