本发明提供了一种配电站房三维模型重建方法、系统、设备和存储介质，包括：利用迭代最近点算法，对预先获取的配电站房点云数据进行配准；利用神经网络对配准后的配电站房点云数据进行分类，并基于分类的配电站房点云数据利用BIM生成各配电站房单体三维模型；基于配准后的配电站房点云数据，利用最小二乘拟合算法对各配电站房单体三维模型进行位置拟合，得到配电站房三维重建模型；配电站房点云数据包括配电站房外部结构和内部设备点云数据；本发明通过迭代最近点算法进行点云数据配准，便于神经网络分类，通过分类可提高BIM生成单体模型的速度和准确率；通过最小二乘拟合算法拟合各单体模型的位置，可提高配电站房三维重建的效率和精度。