本发明提供提取多孔材料孔隙特征和流体分布的方法与系统，能够准确提取孔隙连通性和界面面积信息，表征材料的真实孔隙情况和流体分布情况。方法包括：步骤1，对试样进行三维扫描成像和图像预处理；步骤2，确定入口面，对入口面上体素逐个进行判断，保存至数组B中；确定出口面，对出口面上体素逐个进行判断，保存至数组C中；步骤3，对既不位于入口面，也不位于出口面上的那些内层，由外至内逐层判断孔隙体素的连通性；步骤4，根据数组B和C，对所有孔隙体素的连通性坐标进行判断，全连通孔隙体素保存到数组D中；半连通孔隙体素保存到数组E中，封闭孔隙体素保存到数组F中；步骤5，根据数组D、E、F确定试样的孔隙特征和连通性情况。