本发明提出了一种附加约束站的电离层总电子含量预测系统及方法。服务器计算得到修正后太阳指数及地磁指数，构建太阳指数、地磁指数样本并标记对应的总电子含量标签，输入反向传播神经网络训练得到预测模型；获取四个观测站的多个采集时刻的总电子含量，反距离加权内插得到预测点的各时刻的总电子含量。构建当前及上一时刻的太阳、地磁指数样本，通过神经网络得到当前及上一时刻的预测总电子含量；对预测总电子含量进行修正。计算预测点当前及上一时刻的修正后总电子含量差值，计算各观测点当前及上一时刻的总电子含量差值的平均值，比较二者差异，结合差异阈值确定最终预测点的总电子含量。本发明实现区域高精度电离层总电子含