本发明公开了一种基于虚拟储能的配电网多层协同控制方法，包括：1、获取虚拟储能系统可调有功、无功功率范围，建立虚拟储能出力的数学模型；2、构建配电网多层协同控制上层模型，确定上层目标函数，获取上层控制模型约束；3、构建配电网多层协同控制下层模型，确定下层目标函数，获取下层控制模型约束；4、采用NSGA‑II算法和引入人工蜂群的自适应粒子群算法分别对上下层控制模型进行求解，并通过迭代搜索算法对模型进行博弈，以迭代更新的方式实现上下层决策变量的传递，得到配电网多层协同控制模型的Nash均衡解。本发明能有效解决新能源参与下配电网系统安全运行问题，并提高分布式资源消纳能力，从而保障配电网安全高效运行。