本发明提供一种含蜡油品的降凝催化剂及其制备方法和应用，降凝催化剂包括：复合载体、以及负载于复合载体上的活性金属组分，复合载体包括分子筛载体和非分子筛载体，分子筛载体包括改性分子筛，改性分子筛是由分子筛原料经改性剂改性得到，改性剂包括元素周期表中第IV族中的至少一种非碳元素，分子筛原料包括SAPO‑42分子筛和ZSM‑23分子筛。本发明的降凝催化剂具有良好的加氢异构活性和选择性等性能，适用于柴油等组分较为复杂的含蜡油品的降凝处理，并能够提高降凝后油品的收率和品质。