本申请提供一种基于飞行控制器的半实物仿真系统，涉及飞行控制仿真技术领域。该系统包括数据采集卡和上位机，其中，数据采集卡与上位机通信连接；数据采集卡用于与待仿真的飞行控制器通信连接，实时采集待仿真的飞行控制器的控制信号数据，并将控制信号数据发送给上位机；上位机包括处理模块，且上位机上运行有仿真模型；该仿真模型用于对控制信号数据进行仿真，获得仿真中间数据；处理模块用于对仿真中间数据进行计算，获得仿真结果。本申请通过数据采集卡对飞行控制器的数据进行实时采集，并能在上位机上对该数据进行仿真模拟，半实物仿真过程在降低实验成本的基础上，可对飞行控制器的稳定性和安全性进行判断。