本发明公开了一种水产养殖尾水分段式净化系统，包括初级净化池、二次处理池、自动加药机和尾段处理池，所述初级净化池的进水管与外界尾水送水管连接，所述初级净化池的出水管与二次处理池的进水管之间连接有水泵一，所述初级净化池的内侧滑动安装有框架，所述二次处理池的出水管与尾段处理池的进水管之间连接有水泵二，所述自动加药机的两个加药管其中一个延伸至初级净化池，另外一个延伸至二次处理池内；本发明通过将尾水通过初级净化池的絮凝沉淀和过滤处理，再经过二次处理池中氧化还原处理，最后进入尾段处理池进行水质监测，通过分段式处理逐级提升尾水的净化过程，且不需要人工加药，自动化程度高，提高了净化处理的工作效率和净化效果。