本发明公开了一种水电站集控一体化智慧管理系统，包括数据采集层、数据存储层以及异构数据融合层；数据采集层用于获取多源异构数据；数据存储层用于根据数据类型和数据更新周期存储在不同集控数据库中；异构数据融合层包括元数据库、数据处理单元和数据融合单元，元数据库用于定义不同数据格式的元数据模板；数据处理单元用于基于集控指令调用不同集控数据库中的多源异构数据，并对多源异构数据进行初步数据加工；数据融合单元用于根据调用路径的情况确定元数据库中匹配的元数据模板，基于匹配到的元数据模板对多源异构数据进行融合处理；本发明解决了来自不同自动化系统的多源异构数据的融合问题，实现水电站集控相关数据的全局共享。