本发明提供一种富含水飞蓟宾及水飞蓟蛋白的饮品及其制备方法，本发明通过食品工艺技术，通过三步将水飞蓟籽仁加工成富含水飞蓟素和水飞蓟蛋白的食品，既可以满足人民群众对功能性食品的需求，又能有效利用资源，促进环境和社会的可持续性发展。本发明制备方法不使用有机试剂，具有安全性，采用加热和弱碱处理，获得水飞蓟宾和水飞蓟蛋白，实现药效成分和蛋白的同步提取。提取液经过调味和灭菌处理，成为一种富含水飞蓟宾及水飞蓟蛋白的饮品。本发明所得产品可用于在日常膳食中补充水飞蓟宾和水飞蓟蛋白，为人民群众通过膳食补充水飞蓟素提供了新选项，为药食同源技术的研究和发展打开了新思路。