本发明属于药物化学技术领域，公开了一种蒿甲醚杂质、制备方法及其应用，该新杂质蒿甲醚杂质结构式如下：本发明的新杂质可以为β‑蒿甲醚的质量研究及质量控制和临床安全用药提供合理的标准参考，从而保证β‑蒿甲醚的临床应用更加的安全、有效。同时，其制备方法操作简单、不需要耗费大量的试剂，制备成本低，获得的杂质纯度高，质量好，为β‑蒿甲醚进行杂质限度制定以及其它安全、有效性问题提供技术支持。利用该杂质作为对照品应用于β‑蒿甲醚原料药的质量控制，提高了β‑蒿甲醚原料药的安全性、有效性和可靠性。