本发明公开了一种船用燃料电池的排气装置，涉及氢燃料电池技术领域，排气装置包括箱体、排气组件和检测组件。箱体内设有用于容纳燃料电池第一腔室和第二腔室。排气组件包括控制器及连接控制器的第一排气机和第二排气机，两个排气机分别连通第一腔室、第二腔室和箱体外部。检测组件包括连接控制器的第一检测器和第二检测器，分别设于第一腔室和第二腔室。当第一腔室或者二腔室的氢气浓度超标时，控制器控制第一排气机或者第二排气机工作，对应腔室的氢气抽出，无需同时启动第一排气机和第二排气机，从而大大地节省了工作能源。