本发明提供一种基于数控系统的组态配置方法、装置、设备及存储介质，涉及数控自动化加工技术领域。其中方法包括：获取数控系统的版本信息；根据所述版本信息，生成与所述版本信息对应的人机交互界面信息，并显示预设的通讯输入界面；当检测到针对所述通讯输入界面输入的通讯信息时，基于所述通讯信息，获取设备信息；根据所述设备信息，生成驱动装置组态信息；以及，根据所述设备信息，生成可程式化逻辑控制器信息；根据所述人机交互界面信息、所述驱动装置组态信息和所述可程式化逻辑控制器信息，控制所述数控系统装配。本发明通过根据数控系统的版本信息生成对应的用于组态装配的信息，实现了数控系统组态配置的高效性和灵活性。