本申请提供一种燃料电池系统散热调节方法、装置、介质和车辆。该方法基于燃料电池系统中的每个热交换器的换热能力信息、需求换热量和需求流量确定每个热交换器所负载的目标换热量和目标流经流量，使目标换热量处于对应的热交换器在对应的目标流经流量下的换热量范围之内；再根据与每个热交换器对应预设的液体流阻特性关系和目标流经流量计算出水泵的第一值和与对应调节阀的第二值；根据目标换热量、目标流经流量以及空气流阻特性关系计算出对应风扇的第三值；将水泵的转速调整至第一值，将调节阀的开度调整至第二值，将风扇的转速调整至第三值。本申请提高了各个热交换器换热量分配的合理性。