本发明公开了抗新型冠状病毒N蛋白单域抗体、融合蛋白及其编码基因和应用。本发明通过免疫羊驼构建抗体基因库，筛选得到抗新型冠状病毒N蛋白单域抗体N1D12，其3个互补决定区的氨基酸序列分别为SEQ IDNO.1‑.3所示。本发明进一步将所述的单域抗体N1D12与IgG‑Fc构建得融合蛋白。本发明所提供的单域抗体活性高,与新型冠病毒N蛋白具有较强的结合能力，作为检测抗体采用ELISA检测方法能够准确检测样品中新型冠病毒N蛋白的含量。本发明所提供的单域抗体或该单域抗体与IgG‑Fc构建得到的融合蛋白能够应用于制备检测2019‑新型冠状病毒N蛋白的试剂或制备治疗新冠状病毒感染所引起疾病的药物。