本说明书实施例提供一种水生物监测系统与方法，该方法包括：获取待监测水体的传感数据，传感数据基于部署于待监测水体中多个预设点位的水生物监测单元采集，传感数据至少包括图像数据，图像数据包括水面图像和水下图像；基于传感数据，确定水生物的预估数量，水生物至少包括浮游生物、自游生物和底栖生物；基于水生物的预估数量，确定多个退化度，多个退化度包括第一退化度和第二退化度，第一退化度包括水生物多样性退化度，第二退化度包括水生物数量退化度；响应于多个退化度中的一个或多个满足预设条件，生成预警信息并向用户提示。