本发明公开了一种区域综合能源系统多能互补优化方法、装置及系统，所述方法包括获取供能成本评价模型、供能稳定评价模型和一次能源利用率评价模型；基于获取到的不同供能设备和储能设备的数学模型，以及所述供能成本评价模型、供能稳定评价模型和一次能源利用率评价模型，以供能成本最低、供能稳定性最好、一次能源利用率最高为优化目标，以负荷平衡、各供能设备供能特性及储能设备能量状态为约束，构建优化模型；利用多目标自适应优化算法求解所述优化模型，得到区域综合能源系统中各负荷、供能设备和储能设备的最佳调度方式。本发明能够实现区域综合能源系统中源‑网‑荷‑储协同优化，并能够提高优化过程计算效率。