本申请提供基于知识图谱推理的合成致死基因对预测方法、装置、设备及介质，所述方法包括：获取合成致死知识图谱和已知合成致死基因对；将合成致死知识图谱和由已知合成致死基因对所构成的合成致死图合并生成对应的异构图，以基于异构图及预设起始基因构建得到一用于预测所述预设起始基因的若干个搭档基因的预测模型；基于一多分类损失函数来训练优化预测模型。本发明在无需采样邻居的前提下充分利用KG的结构预测SL关系并对预测过程进行解释，将SL预测问题定义为搭档基因的推荐问题。实验表明，在三种数据划分场景下，KR4SL在NDCG，(56)对比文件杨瑞达;林欣;杨燕;贺樑;窦亮.基于混合增强智能的知识图谱推理技术研究.计算机应用与软件.2019,(第06期),全文.陈德华;殷苏娜;乐嘉锦;王梅;潘乔;朱立峰.一种面向临床领域时序知识图谱的链接预测模型.计算机研究与发展.2017,(第12期),全文.