本发明属于电力电子技术领域，提出了单电感双输出开关变换器的混沌镇定控制方法及其装置，包括：将计算所得的每周期电容电流、输出共模电压、输入电压、共模电压参考和三角波发生器的输出结果共同送入第一混沌镇定控制单元得到载波1；将计算所得的每周期电容电流、输出差模电压、输入电压、差模电压参考和三角波发生器的输出结果共同送入第二混沌镇定控制单元得到载波2；利用载波1和输出支路a的输出电压产生PWM控制信号，驱动主开关管S1；利用载波2和输出支路b的输出电压生成PWM控制信号，驱动支路a的开关管Sa和支路b的开关管Sb。本发明利用电容电流和输出电压的变换代替电感电流，通过混沌镇定控制方法，扩大了变换器的稳定性范围。