本说明书公开了一种模型训练的方法以及分子结构信息的推荐方法及装置，通过获取到的数据集，构建出指定蛋白降解靶向嵌合体的三维分子图信息，该三维分子图信息充分的表征出指定蛋白降解靶向嵌合体的分子结构的各种特征，将该三维分子图信息输入到预测模型中后，预测模型会根据三维分子图信息，来预测与指定蛋白降解靶向嵌合体组合成具有预设药物功能的分子片段的片段信息，作为目标片段信息，进而根据预测出的目标片段信息以及与指定蛋白降解靶向嵌合体对应的标签分子片段的片段信息之间的偏差，对预测模型进行训练，使得后续在预测分子结构的过程中，可以通过该预测模型实现快速、准确的分子片段预测，从而提高了分子片段探索的效率以及准确性。