本发明公开了一种食淀粉乳杆菌胞外囊泡的制备方法，其包括步骤：接种食淀粉乳杆菌进行培养，将发酵菌液离心，去除菌体沉淀，将上清液过滤，将得到的滤液使用高级离心管离心，将超滤液超速离心，将得到的沉淀重悬、过滤，获得所述食淀粉乳杆菌胞外囊泡。上述制备方法或其制备的食淀粉乳杆菌胞外囊泡可应用于制备预防或治疗胆汁淤积性肝病的制剂、制备胞外囊泡载药系统等。本发明以食淀粉乳杆菌的生长曲线为切入点，以特定培养时间扩大菌体产量，结合超滤法滤过小分子蛋白等杂质，再以超速离心法分离出胞外囊泡，从而获得高浓度的菌源胞外囊泡，提供了一种高效、高纯度、低成本的胞外囊泡制备方法，且不会破坏囊泡结构。