本发明提供了一种生物靶向调节肥及其制备方法和应用，涉及生物肥料技术领域。本发明的生物靶向调节肥，包括如下质量份数的组分：牛粪26～78份、羊粪18～54份、底泥13～26份、水17～42份、微生物菌剂0.09～0.2份、干草0.9～2.1份。按照该组分制备得到的生物靶向调节肥实现了污染物的资源化、产品化、应用化，即将“污染物”变成“资源”，生产生物靶向调节肥产品，应用于草地修复，以提高草地土壤养分，从而提升草地产草量、增加草地植被覆盖度。在解决湖泊水质不达标、底泥处理困难、牛羊粪污染、草地退化等问题后，将减少地表径流，从而减少进入湖泊的物质总量，达到源头防治效果。