本申请公开了一种串并联型多端口柔性互联设备的充电控制方法及装置，涉及柔性互联技术领域，本申请提供的方案通过优化串并联型多端口配电网柔性互联设备启动时的预充电工序，在预充电进行到最后阶段时，通过比较装置中各个功率子模块的电压参数，按照各个功率子模块的电压高低，将这些功率子模块分批切除，逐步将各个功率子模块的电压平滑充电至额定电压为止，从而缩小预充电压与实际设定电压偏差，从而达到减弱冲击电流的效果，保障了设备中各器件的正常运行。