本发明提供了一种骨填充材料及其制备方法和应用，涉及生物医用材料技术领域。本发明提供的骨填充材料，主要由原料A、胶原蛋白和羟基磷灰石制备得到；原料A和胶原蛋白构成互穿网络结构，其中，原料A以物理吸附的方式吸附在胶原蛋白上，原料A与原料A之间通过交联剂交联，胶原蛋白与胶原蛋白之间共价交联；羟基磷灰石以物理沉积的方式沉积在胶原蛋白上；原料A包括透明质酸或者壳聚糖。本发明提供的骨填充材料，在传统胶原蛋白/羟基磷灰石骨填充材料的基础上，引入透明质酸或者壳聚糖，使其与胶原蛋白交联形成互穿网络，提高骨填充材料的机械性能和降解性能，避免材料脱落，具有作为骨修复材料应用的潜力。