本申请提供的基于智慧医疗的先天性心脏病报告数据筛选方法及系统，基于第二目录描述矩阵筛选与心脏检测数据关联的指定数目个目标待定主题，根据所述目标待定主题确定出对应的文件种类。以此，本发明提供的基于智慧医疗的先天性心脏病报告数据筛选方法，可以对获得到的心脏检测数据进行关键属性解析，并根据关键属性解析的结果搭建先天性心脏病数据属性描述集，根据先天性心脏病数据属性描述集中的事件优化目录描述矩阵，从而在进行进行筛选时，能够提高数据筛选的准确性和可靠性，从而能够确定出筛选出来的文件种类是相同和相似的，这样一来，可以提高后续工作的工作效率。