本申请提供了一种医学短文本的分类方法、装置、电子设备及存储介质，包括：获取电子病历数据中的待分类短文本；所述待分类短文本为非结构化文本；将所述待分类短文本输入至预先训练好的文本分类模型中，确定所述待分类短文本的文本类型；其中，文本分类模型为基于知识蒸馏方法由预先训练好的教师模型指导训练得到的学生模型；学生模型为具有多个多层卷积神经网络串联结构的模型，每层卷积神经网络中具有卷积核不完全相同的多个并行卷积神经网络；所述教师模型中包括使用医学短文本数据进行预训练和微调后得到的医疗BERT模型和多个全连接层。这样，通过本申请提供的技术方案，可有效的提高推理速度，并且可以应用到医院场景中。