本发明提供了一种落压式到落压式推进系统在轨加注的流量稳定控制方法，其特征在于，包括获取补加系统在期望稳定流量下的总流阻；获取贮箱实时压力参数，给出电动泵在设定期望稳定流量下的实时期望扬程；补加系统通过服务卫星与受体卫星之间的贮箱压差来驱动推进剂稳定流动；获取设定期望稳定流量下的电动泵的转速需求；控制电动泵按需求转速运行，驱动推进剂按设定期望流量区间进行稳定传输；在电动泵驱动补加过程中，通过超声波流量计测量瞬时补加流量及累计补加总量，驱动直至累计补加量满足要求。本发明结合了服务卫星及受体卫星在推进剂补加过程中贮箱压力的变化特点，是完全为高轨常规高价值目标量身定做的在轨流量稳定控制方案。