本发明公开了一种基于内生真菌来源的吡喃酮类化合物及其制备方法和应用，所述吡喃酮类化合物来源于蓝花黄芩内生真菌Ascomycotasp.FAE17菌株，经菌株发酵物制备、发酵物经乙酸乙酯萃取后减压浓缩萃取液得到乙酸乙酯萃取浸膏，经柱色谱分离纯化得到吡喃酮类化合物，分别为化合物1、化合物2、化合物3和/或化合物4。所述吡喃酮类化合物经多种体外活性评价结果表明：上述吡喃酮类化合物具有抗菌和抗炎活性，可以进一步开发成抗炎药物，具有开发成抗炎药物的前景，尤其是在抑制一氧化氮生成方面的抗炎药物中的应用。