本发明提供一种图谱合并方法、装置、电子设备及存储介质，所述方法包括：获取待合并的两个故障根因图谱，包括第一图谱和第二图谱；基于第一图谱和第二图谱，确定多个目标节点对；对于每一目标节点对执行以下操作：获取目标节点对中的两个目标节点的聚合特征向量；将两个目标节点的聚合特征向量输入至训练完成的第一模型，得到两个目标节点连接的概率值；在两个目标节点连接的概率值大于预设阈值的情况下，确定两个目标节点存在传播概率，则将所述两个目标节点进行连接；在遍历完所有目标节点对后，输出合并后的故障根因图谱。本发明可以实现对网络中存在的链接和缺失的链接的准确、全面、均衡的预测，能够准确地合并故障根因图谱。