本发明提供一种在轨数据的传输方法、系统及设备，应用于在轨航天器，方法包括：获取航天员的生理参数；将所述生理参数转换为数字信号；对所述数字信号进行一级编码处理，得到第一编码结果；对所述第一编码结果进行二级编码处理，得到第二编码结果；根据所述第一编码结果和第二编码结果，得到数据传输帧；将所述数据传输帧通过至少一中继卫星传输至地面接收终端，由所述地面接收终端对所述数据传输帧进行解码后存储。本发明的方案，能够减少数据传输错误和丢失的风险，确保航天员生理参数数据的完整性和准确性。