本发明公开了一种高效表达肌源性因子鸢尾素Irisin的益生菌制备及其应用，属基因工程技术领域。该高效表达肌源性因子鸢尾素Irisin的益生菌制备的步骤为：通过使用HindIII和BamHI限制性内切酶双酶切NSP4‑Irisin‑HA序列以及pUC19载体，将鸢尾素Irisin构建pUC19质粒上，将构建好的质粒pUC19‑NSP4‑Irisin‑HA通过电转至益生菌EcoliNissle1917中，构建高效表达肌源性因子鸢尾素的益生菌，高表达鸢尾素Irisin益生菌灌胃可以提高小鼠体内鸢尾素Irisin含量，改善其肠道功能，有效减轻体重，结果表明，口服补充高表达鸢尾素Irisin益生菌是一种有效提高鸢尾素Irisin表达的方法。在提高鸢尾素Irisin表达领域具备较好的推广和应用前景。