本发明属于制造业分布式生产调度领域，具体涉及一种用于多目标可持续分布式异构工厂的流水车间调度系统，包括协同初始化模块、自学习操作的局部搜索模块和碳节约速度调整模块。所述协同初始化模块设计了一种协同初始化策略。所述自学习操作的局部搜索模块设计了一种自学习操作的局部搜索策略，将每个操作的历史成功率总结为知识，以指导算法进行自学习操作选择，增强所提出算法的精搜索能力。所述碳节约速度调整模块设计了一种碳节约速度调整策略，该策略调整非关键路径上某些工件的加工速度，同时保持关键路径上工件的加工速度不变。本发明可以将优化器扩展到满足当前智能制造生产领域中的大多数调度问题中，如选址问题、车辆路径规划问题等。