本发明提供了一种湖泊超额分洪量的计算方法，属于水利防洪技术领域，包括如下步骤：对湖泊进行分区，通过河段水量平衡方程及蓄水量和出流量的关系式构建湖泊分区串联洪水演进模型；根据降雨形成的产流过程、径流过程及汇流过程构建产汇流耦合模型；通过产汇流耦合模型计算降雨汇入湖泊各分区的产流量；通过汇入湖泊各分区的产流量及湖泊分区串联洪水演进模型计算各分区的槽蓄量和出流量；根据各分区的槽蓄量和出流量评估湖泊各分区的超额分洪量。本发明通过定量评估湖泊分蓄洪能力，能够统筹解决湖泊各分区承担的超额分洪量，对长江中下游防洪布局进行优化，协调湖区战略发展与防洪保安的关系，使湖泊的防洪能力达到蓄洪防御要求。