本发明公开了一种脱硫废水预处理系统及方法，包括过滤箱以及置于过滤箱内的过滤装置，过滤箱上分别设置有废水进口、滤液出口及泥浆出口，其中，废水进口位于过滤装置的下方；泥浆出口位于废水进口的下方；滤液出口位于过滤装置的上方；过滤箱的顶部设置有加药区，废水进口与进水管相连通，泥浆出口连接有泥浆排放管，过滤装置包括自上到下依次分布的若干过滤板，且自上到下各过滤板的孔径逐渐增大，该系统及方法具有体积小、杂质过滤彻底以及过滤除杂效率高的特点。