本发明公开了一种用于防治疱疹病毒感染的胎盘源细胞因子制备方法及其制剂的应用。具体地说，本发明涉及采用胶原酶Ⅰ、胰蛋白酶、木瓜蛋白酶三联酶，通过调整酶的组成、PH值、温度和时间，进行分级解离胎盘组织，收集胎盘组织解离液，用交联葡聚糖Sephadex凝胶柱分离胎盘组织解离液中的活性物质，获得多种必需的氨基酸、小分子活性肽、免疫球蛋白、脂多糖等；同时从胎盘组织解离液中贴壁收集原代胎盘源间充质干细胞，通过体外增殖培养，诱导间充质干细胞高表达活性因子，主要为白细胞介素（IL）、集落刺激因子（CSF）、肿瘤坏死因子（TNF）、干扰素（IFN）、表皮生长因子（EGF）、转化生长因子（TGF）等，合并收集，我们将它们称为胎盘源细胞因子。将胎盘源细胞因子冻干制备成样品和制剂，通过体外HELFF细胞感染疱疹病毒试验、小鼠睾丸感染单纯疱疹病毒试验和临床疱疹病毒感染患者的抗杀疱疹病毒作用，活性测定结果显示，从胎盘组织提取活性细胞因子合并胎盘源间充质干细胞制备得到的胎盘源细胞因子，可显著抑制疱疹病毒导致HELFF细胞和小鼠睾丸的病变发生，修复疱疹病毒感染导致HELFF细胞坏死和小鼠睾丸组织损伤，并且临床应用上也表现较强的抗杀单纯疱疹病毒作用，尤其对耐药株感染者。