本发明提供DCS控制器串口安全接入方法、系统、设备及存储介质，包括：监听DCS控制器的串口的接入操作，当监听到有串口工具接入所述DCS控制器的串口时，检测所述DCS控制器上是否有USBKey设备插入，如果没有USBKey设备插入，则阻断所述串口工具与所述DCS控制器的串口之间的信号连接；如果有USBKey设备插入，则对USBKey设备进行身份认证，若身份认证失败，则阻断所述串口工具与所述DCS控制器的串口之间的信号连接，若身份认证成功，则接通所述串口工具与所述DCS控制器的串口之间的信号连接。本发明解决了DCS控制器现场运维业务中遇到的运维工具身份认证的薄弱性问题。