本发明提供一种分析海洋底栖动物埋藏和翻砂习性的方法及应用，涉及生物研究领域。该分析海洋底栖动物埋藏和翻砂习性的方法，包括水池，所述水池的内部设置有液体，位于所述液体内部水池的下内壁上设置有底质模拟装置，位于所述水池的上端设置有盖板，所述水池的前侧设置有补光板，所述水池的另一侧设置有图像分析电脑，所述图像分析电脑的另一端电性连接有数据采集装置。通过利用摄像头等数据采集设备长期或定期对这类生物在底质中的活动进行记录，然后通过图像分析软件等分析其在底质中的活动轨迹，为后期深入分析和研究这类生物在底质中的习性和对底质的影响提供了条件。