本发明涉及环境评估技术领域，特别是一种基于物联网的全氟化合物污染评价方法及系统，获取目标企业的预设排放源，根据所述预设排放源确定出监测区域，根据所述监测区域的地形条件规划出采样点布局图，在第一预设时间节点对采样点布局图中各预设采样点进行采样检测，得到第一全氟化合物分布情况图；在第二预设时间节点对采样点布局图中各预设采样点进行采样检测，得到第二全氟化合物分布情况图；对第一全氟化合物分布情况图与第二全氟化合物分布情况图进行分析，得到监测区域中全氟化合物在各个迁移方向上的平均迁移速度，通过本方法能够自动且准确的评价出全氟化合物在各个迁移方向上的迁移速度。