本发明提供了一种龙门吊轨道梁横跨大直径盾构端头井施工方法，包括以下步骤：S1：放样定位轨道梁位置；S2：利用现有车站两侧的永久侧墙或边柱上的顶板环框梁施工钢筋制安时，同时进行悬挑梁钢筋制安并预留立柱钢筋，顶板及悬挑梁混凝土整体浇筑；S3：立柱钢筋制安，立模浇筑混凝土，养护；S4：钢箱梁加工以及钢箱梁定位安装；S5：轨道安装；S6：龙门吊试运行。本发明通过优化计算，与常规方法结构底板施工立柱至地面工艺相比，本发明充分发挥了永久结构侧墙、立柱及环框梁混凝土结构的承载及抗扭性能，避免底板至顶板的超高立柱施工风险，同时省去超高立柱拆除工序，缩短了工期，节约了成本，安全可靠。