本发明属于工业自动化技术领域，公开了可信DCS上位机系统的部署方法、系统、设备及存储介质，方法包括：判断待部署上位机是否可信；若可信，增加新用户，安装rpm包；对待部署上位机配置参数，并在/user/dcs文件夹下，将配置参数写入对应的配置文件dcs.xml中；安装QT、Python动态库到/usr/local文件夹下；判断DCS系统的/user/dcs文件夹中是否已安装DCS系统，若安装，根据配置参数的安装类型，将对应的功能模块安装到/user/dcs文件夹中；在DCS系统config文件中写入安装类型对数据库、画面、工具的执行权限；将DCS系统的所有可执行应用添加到可信白名单中，并验证是否可以启动成功，若成功，则可信DCS上位机系统部署完成。本发明能够实现可信DCS上位机系统的快速部署。