本发明涉及燃料电池技术领域，尤其涉及一种生物质碳材料、其制备方法及应用。所述制备方法包括：A)将棉纤维材料进行预处理；B)与硼酸水溶液混合，超声处理；C)在200～250℃进行预氧化，得到预氧化碳材料；D)在还原气气氛下，将所述预氧化碳材料在900～1100℃碳化；E)在1000～2000℃退火；F)在惰性气氛中通入碳源气体，加热；G)进行酸处理，得到生物质碳材料。本发明的制备条件更为缓和，大大降低碳纤维布制备的工业能耗，制备工艺简单，无需疏水处理，制得的生物质碳材料的导电性、孔隙率、疏水性能均较优，足以与市面上的碳纤维布媲美，可以代替市面上碳纤维布作为燃料电池的气体扩散层。