本发明公开了一种化学酶法偶联合成氟苯尼考的方法，以β‑氟丙酮酸钠盐、对甲砜基苯甲醛和D‑丙氨酸为底物，在丙酮酸脱羧酶和转氨酶的级联催化下，“一锅法”合成氟苯尼考胺，再经酰胺化反应合成氟苯尼考。合成路线包括：β‑氟丙酮酸钠盐和对甲砜基苯甲醛在丙酮酸脱羧酶的催化下生成(1R)‑3‑氟‑1‑羟基‑1‑对甲砜基苯基‑2‑丙酮；(1R)‑3‑氟‑1‑羟基‑1‑对甲砜基苯基‑2‑丙酮和D‑丙氨酸继续被反应体系中的转氨酶转化为氟苯尼考胺，最后氟苯尼考胺经一步化学的酰胺化反应合成氟苯尼考。本发明与传统的氟苯尼考化学合成法相比，步骤更少，且中间涉及构型的步骤均由高立体选择性的酶催化替代，省却拆分步骤，反应过程更加绿色环保，原子经济性更高，适宜推广应用。