本发明属于飞行器导航技术领域，具体涉及一种基于导航数据库航径的机载垂直导航偏差监控的计算方法，旨在解决现有的机载垂直导航偏差监控方法计算的偏差精度较低的问题。本方法包括：根据待监控垂直导航偏差的航空器的机载导航定位信息，确定航空器所处的飞行航段；获取飞行航段对应的航段终止码类型，并结合航空器的位置信息，计算航空器至飞行航段的终止点的沿水平航迹距离；根据沿水平航迹距离，结合航段标称高度及垂直航径角，确定标称气压高度；计算标称气压高度与QAR记录的气压高度的偏差，作为航空器的垂直导航偏差的监控结果。本发明提高了机载垂直导航偏差计算的精度。