发明公开
- 专利标题: 基于LP-WGS和DNA甲基化的肺癌早筛模型构建方法及电子设备
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申请号: CN202311311093.5申请日: 2023-10-10
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公开(公告)号: CN117275585A公开(公告)日: 2023-12-22
- 发明人: 赵杰 , 李晓敏 , 薛茹月 , 吴梦思 , 杨梅佳 , 邓望龙 , 张旭 , 张超 , 李砺锋 , 王小强 , 祁闯 , 段晓冉 , 闫芮 , 任用
- 申请人: 郑州大学第一附属医院
- 申请人地址: 河南省郑州市二七区建设东路1号
- 专利权人: 郑州大学第一附属医院
- 当前专利权人: 郑州大学第一附属医院
- 当前专利权人地址: 河南省郑州市二七区建设东路1号
- 代理机构: 太原九得专利代理事务所
- 代理商 高璇
- 主分类号: G16B40/20
- IPC分类号: G16B40/20 ; G16B20/00 ; G16B30/10 ; G16H50/30 ; G16H10/40
摘要:
本申请实施例提供基于LP‑WGS和DNA甲基化的肺癌早筛模型构建方法及电子设备,包括,采集肺癌患者和健康人的外周血,提取cfDNA,建立样本集;基于cfDNA,进行低深度全基因组及甲基化靶向的测序,构建测序文库;对低深度全基因组测序数据、甲基化靶向测序数据进行特征提取,得到全基因组测序数据的片段特征、甲基化靶向测序数据的甲基化特征;根据全基因组测序数据的片段特征、甲基化靶向测序数据的甲基化特征及甲基化数据的片段组特征,构建基于多特征交叉堆叠的肺癌早筛预测模型;通过样本集对肺癌早筛预测模型进行训练和验证,得到最终的肺癌早筛预测模型和预测结果;具有无创的、能够对早期肺癌进行高准确率预测的有益效果,适用于生物医学的技术领域。