本发明公开了一种燃气轮机转子在线动平衡的方法，包括：压气机壳体，壳体内设有压气机叶片；燃烧室壳体，其一侧与所述压气机壳体相连，壳体内设有所述压气机叶片以及透平动力叶片，根据需要更换叶片位置拆除相对应的壳体，利用燃机的盘车机构将转子转到适当的角度，依次拆卸并更换新叶片；配重块安装口，设于所述燃烧室壳体的侧壁上；排气室，与所述燃烧室壳体的另一侧相连接；测量系统模块，采用燃气轮机发电机组自身的人机交互系统，解决燃气轮机更换叶片后转子剩余不平衡量超差的问题,减少燃气轮机大分解、拆卸罩壳、拆除相关成套系统、长途运输转子及复装等过程。