本发明公开了一种混合结构的双绕组转向电机电流均衡控制方法及系统，该方法综合了矢量空间解耦坐标变换和双dq坐标变换的优势，可使两个绕组的电流保持平衡，同时消除了绕组之间的耦合现象，从而提高线控转向系统的控制性能；接收参考电流信号并通过变换矩阵将实际电流信号转换为参考电压信号，解耦变换器进一步处理参考电压信号，得到实际电压信号；通过Park逆变换和SVPWM将实际电压信号转化为驱动电流，驱动双绕组电机转动。本发明消除了双绕组转向电机的电流不均衡现象，提高转向角度跟踪控制性能，并具有更好的一般性和控制性能。该发明有望应用于线控转向系统等领域，提高系统的工作效率和稳定性。