本申请涉及智能医疗领域，具体涉及一种基于知识图谱与自然语言处理技术的临床决策方法、系统及设备。包括获取临床数据；将所述临床数据输至构建好的知识图谱辅助进行临床决策得到临床决策方案。其中，所述构建好的知识图谱的构建过程为：获取临床医学数据集；定义临床本体概念模型、本体关系模型；所述本体概念模型采用自顶向下和自底向上相结合的方法构建得到；基于所述本体概念模型、本体关系模型对所述临床医学数据集进行标注得到标注后的数据；对所述标注后的数据进行实体识别得到实体数据；将所述标注后的数据、所述实体数据通过图数据结构存储得到知识图谱。该方法能够有效提取临床数据中实体与实体关系，进而提高临床决策的可信度。