一种高温固体氧化物燃料电池的交流阻抗在线测试方法，包括：在电池堆接入实验台前，测量实验台在空载条件下的交流阻抗数据，并将其作为实验台的背景阻抗；电池堆接入实验台并开始带电运行后，每次开展电池堆的EIS在线测试前，通过设备接线切换装置断开电池堆与实验台的连接，并通过设备接线切换装置将电池堆与EIS测试设备连接进行EIS在线测试；基于EIS在线测试后所得的电池堆原始交流阻抗，消除实验台的背景阻抗后得到电池堆校正交流阻抗。本发明通过设备接线切换装置，有效隔绝实验台的电感以及内置元器件噪声信号对EIS测试数据的影响，同时对EIS在线测试数据优化处理，提升了高温固体氧化物燃料电池EIS在线测试结果质量。